體檢成果
調查地點：小琉球厚石裙礁、美人洞、漁埕尾
調查時間：2016-11-23
水溫：26-27度
底質調查顯示，小琉球的各處活珊瑚覆蓋率除了美人洞 10 米處達國際標準「普通」程度外，其餘皆處於「劣化」程度，厚石深處最低，僅紀錄到 0.6%活珊瑚覆蓋率。2015 年厚石裙礁 5 米處活珊瑚覆蓋率曾達 60%以上，今年卻僅有13.8%。各樣點皆觀察到新死珊瑚，可能因今年九月強颱莫蘭蒂對此海域造成重大傷害。雖可見到小株新生軟珊瑚，仍建議這段時間儘量避免過多的人為干擾，並需密切注意本處珊瑚復原狀態。
指標性魚類調查顯示，所有穿越線上都有紀錄到蝶魚，族群密度介於 0.75-8.75 隻/100 平方公尺。 此外，除了漁埕尾外，其他穿越線上也紀錄到鸚哥魚族群密度介於 0.5-3.25 隻/100 平方公尺，裸胸鯙本次則未有紀錄。另外零星紀錄到石鱸、笛鯛及石斑。
指標性無脊椎動物調查顯示除了漁埕尾淺處以外，其他樣點都均可見魔鬼海膽的蹤跡，族群密度介於 0.75－7.25 隻/100 平方公尺，最高為美人洞。美人洞深處和漁埕尾深處都紀錄到清潔蝦，族群密度介於 0.25-0.5 隻/100 平方公尺。相較去年僅在漁埕尾 10 米紀錄了少見的馬糞海膽，今年則在美人洞深淺處及漁埕尾 5 米處有所紀錄，族群密度 0.25-0.75 隻/100 平方公尺 。硨磲貝的部份，除了漁埕尾以外，其餘樣點都有紀錄，族群密度皆為 0.25 隻/100 平方公尺, 以 10-20公分的中小型硨磲貝居多。
除了指標性魚類和無脊椎動物，除了厚石深處以外，調查人員也在其餘各點穿越線附近紀錄到海龜，總共有 13 隻之多，為去年紀錄的兩倍以上，著實反映出小琉球是目前台灣最多海龜棲息的地方。環境衝擊部分，美人洞有船錨損害底質的紀錄，美人洞及漁埕尾亦有為數不少的垃圾，一旦被海龜、魚類誤食，恐影響其存活。小琉球海洋志工隊長期在本處海域進行淨海淨灘，成果斐然，但仍需做好垃圾減量，從源頭開始努力。
