調查地點：公館、柴口
綠島的調查工作有公館與柴口兩地點，在底質調查中，除了公館5m處的裸岩比例大於珊瑚覆蓋率外（50%>38.75%），其餘調查地點的珊瑚覆蓋率均較藻類、沙、泥、碎石等其餘組成為高，平均可達45.15％，其中又以柴口10m處的珊瑚覆蓋率為最（51.88％）。
活珊瑚覆蓋率
公館5米_38.75% / 公館10米_42.5%
柴口5米_47.5% / 柴口10米_51.875%
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在魚類調查裡，綠島各調查地點所紀錄到的魚類仍以蝶魚為主，平均每20公尺可記錄到1.75尾，在公館5m處有紀錄到平均0.5尾鸚哥魚，在柴口5m處也有1.25尾鸚哥、0.5尾笛鯛與0.25尾石鱸的紀錄，整體魚類數量十分稀少。
而無脊椎動物的調查中，紀錄最多的為硨磲貝，平均每樣點紀錄到1.92枚，以公館10m深的100公尺穿越線紀錄到10枚為最，平均每20公尺可以記錄到2.5枚，除了硨磲貝外僅公館5m深的100公尺穿越線中有紀錄到魔鬼海膽兩枚，其餘無脊椎動物均付之闕如，而柴口5m深處則未紀錄到任何無脊椎動物。
指標性魚類
指標性無脊椎動物
